Установка R в Ubuntu 20.04

Популярный открытый язык программирования R специализируется на статистических расчетах и графиках и широко используется в разработке программ для сбора статистики и анализа данных. Одним из преимуществ R является его расширяемость. Активное сообщество R постоянно добавляет новые пользовательские пакеты, которые можно применить для сбора статистики в различных областях науки.

Этот мануал научит вас устанавливать R и добавлять пакеты из официального Comprehensive R Archive Network (CRAN).

Требования

  • Сервер Ubuntu 20.04, настроенный по этому мануалу.
  • Минимум 1 Гб оперативки.

Войдите на сервер как пользователь sudo и приступайте к работе.

1: Установка R

Проект R очень быстро развивается, потому версия R в репозитории Ubuntu уже устарела. Чтобы получить последнюю стабильную версию R, добавьте внешний репозиторий, поддерживаемый CRAN.

Примечание: CRAN предоставляет надёжную поддержку репозиториев, однако следует помнить, что не все внешние репозитории безопасны. Устанавливайте пакеты только из надёжных источников.

Добавьте соответствующий GPG ключ:

sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9

Команда выведет на экран такой результат:

Executing: /tmp/apt-key-gpghome.cul0ddtmN1/gpg.1.sh --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
gpg: key 51716619E084DAB9: public key "Michael Rutter <marutter@gmail.com>" imported
gpg: Total number processed: 1
gpg:               imported: 1

Теперь на сервере есть ключ, с помощью которого он проверит подлинность репозитория, после чего мы можем добавить сам репозиторий. Ubuntu 20.04 также называется Focal Fossa, а последняя версия R называется 4.0.0, следовательно, нам нужен репозиторий

focal-cran40.
sudo add-apt-repository 'deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/'

Примечание: Если вы не используете 20.04, вы можете найти соответствующий репозиторий в этом списке, где содержатся данные обо всех релизах.

В вашем выводе должны быть подобные строки:

...
Get:7 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ InRelease [3622 B]
Get:8 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu focal-cran40/ Packages [15.6 kB]
...

Обновите индекс пакетов, чтобы добавить списки пакетов из нового репозитория.

sudo apt update

В вашем выводе должна быть подобная строка:

...
Hit:2 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/ InRelease
...

Если в выводе команды вы увидели подобную строку, репозиторий успешно добавлен. Теперь можно установить R:

sudo apt install r-base

Нажмите у, чтобы подтвердить установку.

На момент написания статьи последней версией CRAN является 4.0.1, она будет отображаться во время запуска R.

Чтобы библиотеки R были доступны для всех системных пользователей, запустите R как пользователь root. Если вы хотите настроить персональную библиотеку для своего пользователя, запустите команду R без sudo.

sudo -i R
R version 4.0.0 (2020-04-24) -- "Arbor Day"
Copyright (C) 2020 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
...
Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or
'help.start()' for an HTML browser interface to help.
Type 'q()' to quit R.
>

Если на экране появился такой вывод, значит, установка R прошла удачно и теперь вы можете взаимодействовать с интерактивной оболочкой программы.

2: Установка пакетов R из CRAN

Одна из причин популярности R – это огромное количество доступных вспомогательных пакетов и аддонов. Для примера попробуйте установить txtplot, библиотеку графиков ASCII (она включает поддержку точечных, линейных графиков, гистограмм и т.п.).

install.packages('txtplot')

Примечание: Следующий вывод сообщает расположение пакета:

...
Installing package into ‘/usr/local/lib/R/site-library’
(as ‘lib’ is unspecified)
...

Этот путь доступен потому, что ранее вы запустили R как root. Отсюда можно сделать пакет доступным для других пользователей.

После завершения установки можно загрузить txtplot:

library('txtplot')

Если на экране не появилось уведомлений об ошибках, значит, загрузка библиотеки прошла успешно. Попробуйте поработать с ней и создать простой график с осью меток. В качестве примера используются данные пакета datasets, который

содержит скорость и тормозной путь автомобилей на основе данных 1920-х годов:

txtplot(cars[,1], cars[,2], xlab = 'speed', ylab = 'distance')
.     +----+-----------+------------+-----------+-----------+--+
. 120 +                                                   *    +
.     |                                                        |
d 100 +                                                   *    +
i     |                                    *                *  |
s  80 +                          *         *                   +
t     |                                       * *    *    *    |
a  60 +                          *  *      *    *      *       +
n     |                        *         * *  * *              |
c  40 +                *       * *    *  *    * *              +
e     |         *      *  * *  * *  *                          |
.  20 +           *    *  * *       *                          +
.     |  *      *    *                                         |
. 0   +----+-----------+------------+-----------+-----------+--+
5          10           15          20          25
.                            speed

Примечание: Чтобы узнать о txtplot больше, используйте help(txtplot) в интерпретаторе R.

Любой предварительно скомпилированный пакет можно установить из CRAN с помощью install.packages(). Чтобы узнать больше о доступных пакетах, изучите список официальных пакетов.

Чтобы закрыть R, введите q(). Вы можете нажать n при появлении запроса, если вам не нужно сохранить образ рабочего пространства.

Заключение

Теперь язык программирования R успешно установлен на ваш сервер. После этого вы можете установить открытый сервер RStudio, интерфейс для R на удаленном сервере Linux, который предоставляет IDE.

Читайте также:

Tags: , , ,