Установка сервера Shiny Server в Ubuntu 14.04

Published by Leave your thoughts

Shiny – это пакет R, который позволяет преобразовывать код R в интерактивные веб-страницы.  Предоставляемый RStudio сервер Shiny Server используется для размещения и обслуживания приложений Shiny. Кроме того, Shiny Server может обслуживать интерактивные документы R markdown. Shiny Server поставляется в двух версиях: свободный сервер с открытым исходным кодом и платный профессиональный сервер с более широким набором функций.

В этом руководстве речь пойдёт об установке Shiny Server на виртуальный выделенный сервер Ubuntu 14.04. В целом, приведённые здесь инструкции подойдут и для других версий Ubuntu; при использовании других дистрибутивов Linux не забудьте отредактировать некоторые команды. Это руководство поможет установить открытый сервер Shiny, но его можно использовать и для установки Shiny Server Professional.

Требования

Для выполнения инструкций понадобится:

Все команды в руководстве нужно запускать с правами sudo.

Примечание: Вместо yourserverip нужно указать IP-адрес сервера.

1: Установка Shiny

Прежде чем приступить к установке Shiny Server, нужно R-пакет shiny. Чтобы выполнить глобальную установку этого пакета, запустите:

sudo su - -c "R -e \"install.packages('shiny', repos='http://cran.rstudio.com/')\""

Примечание: Некоторые пользователи предпочитают устанавливать пакеты из оболочки R, а не из командной строки. Но в таком случае пакеты будут доступны только для учётной записи, при помощи которой был установлен пакет. Установка пакета R из командной строки – это надёжный способ обеспечить доступ к этому пакету для всех пользователей системы, а не только для пользователя, при помощи которого запускается R.

2: Установка Shiny Server

Для установки Shiny Server понадобится инструмент GDebi. Чтобы загрузить GDebi, используйте:

sudo apt-get install gdebi-core

Теперь всё готово к установке Shiny Server.

Используйте следующую команду, чтобы загрузить Shiny Server (учитывая, что Ubuntu имеет 64-битную архитектуру):

wget -O shiny-server.deb http://download3.rstudio.org/ubuntu-12.04/x86_64/shiny-server-1.3.0.403-amd64.deb

Эта команда загрузит последнюю доступную версию Shiny Server (на данный момент это 1.3.0.403). Узнать о выходе новых версий и загрузить их можно на официальной странице Shiny Server (не забудьте заменить ссылку в команде). Пользователи, использующие 32-битную систему Ubuntu, должны посетить страницу загрузки Shiny Server, чтобы получить отдельные рекомендации для операционной системы.

Теперь используйте GDebi для установки только что загруженного файла:

sudo gdebi shiny-server.deb

После установки Shiny Server будет запущен на порт 3838. Открыв в браузере следующую ссылку, вы увидите стандартную приветственную страницу:

http://your_server_ip:3838/
Welcome!
If you’re seeing this page, that means Shiny Server is installed and running. Congratulations! […]

Чтобы убедиться в том, что сервер работает корректно, откройте ссылку:

http://your_server_ip:3838/sample-apps/hello/

3: Размещение интерактивных документов R markdown

Как уже говорилось ранее, Shiny Server позволяет размещать не только приложения, но и интерактивные документы R markdown.

Примечание: Подробную информацию о таких документах можно найти здесь.

Итак, на данный момент у вас есть сервер Shiny Server, полностью готовый к размещению приложений. Для поддержки интерактивных документов R markdown сервер нуждается в пакете rmarkdown. Shiny Server поставляется с простым интерактивным документом который доступен здесь:

http://your_server_ip:3838/sample-apps/rmd/

Но если попробовать открыть эту ссылку сейчас, на экране появится ошибка. Установите пакет rmarkdown, чтобы устранить её:

sudo su - -c "R -e \"install.packages('rmarkdown', repos='http://cran.rstudio.com/')\""

Теперь Shiny Server готов к обслуживанию документов R markdown. Чтобы убедиться в этом, снова откройте ссылку:

http://your_server_ip:3838/sample-apps/rmd/

4: Установка Shiny Server Professional (опционально)

Если вы купили лицензию Shiny Server Professional, следуйте инструкциям данного раздела.

Вместе с лицензией RStudio предоставит URL-адрес для загрузки файла Shiny Server Pro; загрузите этот файл.

wget -O shiny-server-pro.deb Shiny_Server_Pro_URL

Установите Shiny Server Pro при помощи команды:

sudo gdebi shiny-server-pro.deb

Кроме того, RStudio предоставит специальный ключ, необходимый для активации Shiny Server Pro.

sudo /opt/shiny-server/bin/license-manager activate Product_Key

Перезапустите Shiny Server, чтобы включить версию Professional:

sudo reload shiny-server

Дополнительные рекомендации

Итак, теперь на сервер Ubuntu установлен Shiny Server, позволяющий обслуживать интерактивные документы и приложения.

Конфигурационный файл Shiny Server – /etc/shiny-server/shiny-server.conf. по умолчанию сервер обслуживает приложения в каталоге srv/shiny-server/. То значит, что приложение, находящееся в каталоге /srv/shiny-server/app_name, доступно в сети по ссылке http://your_server_ip:3838/app_name/.

Чтобы узнать, как выполнить пользовательскую настройку сервера и как им управлять, читайте руководство администратора Shiny Server.

Руководство по созданию приложений Shiny можно найти здесь.

Узнать, как пишутся интерактивные документы R Markdown, можно по этой ссылке.

Заключение

Итак, теперь благодаря Shiny Server на виртуальном выделенном сервере можно размещать приложения Shiny и интерактивные документы R Markdown.

Tags: , , , , , ,

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *


*

Можно использовать следующие HTML-теги и атрибуты: <a href="" title=""> <abbr title=""> <acronym title=""> <b> <blockquote cite=""> <cite> <code> <del datetime=""> <em> <i> <q cite=""> <strike> <strong>